Az első film után néhány hónappal járunk. Kenshin rájön, hogy az ő bérgyilkos utódja, Shishio Makoto Japán meghódítását és a Meiji-kormányzat megbuktatását tervezi, Kiotóval kezdve. Attól tartva, hogy Shishio az új barátait is halomra öletheti, úgy dönt, felkutatja az utódját, s megvédi az államiságot...........Rurouni Kenshin: Pokol Kiotóban
